Här kommer mina reflektioner....
Nu har du
gjort både PCR och Southern. Syftet med bägge metoderna var att ta reda på om
LL 37-genen fanns i plasmiden. Jämför resultatet och diskutera för-och
nackdelar med metoderna.
PCR är en
metod som går snabbare än Southern, då Southern innehåller flera steg och dessutom
måste provet ligga över natt.
Dock ska man
vara medveten om att Southern är mycket mer noggrann. Det syns väldigt tydligt
då jag och Emmeli (min laborationspartner) då vår PCR finns med i Southern.
När man
endast gjort gelelektrofores på PCR så syns kontamination av positiv och
negativ kontroll och tydligt man band vid PCR brunn, där vi antar att gen LL37 ska
vandra till. När man gjort hybridisering med probe så syns ingen skillnad
mellan brunn innehållande negativ kontroll, positiv kontroll och PCR prov. Man kan
tydligen se att proven alla prov innehåller LL37, och den negativa kontrollen
var mycket kontimenerad med LL37.
Gelelktrofores. brunn 1- neg. kontroll. brunn 7 - PCR-prov. brunn 8 - pos. kontroll
Efter hybridisering med probe. Neg. & pos. kontroll brunn 1,8. PCR-prov brunn 7.
Vad tycker
du är det viktigaste som du har lärt dig under laborationen?
Under laborationerna
har vår laborationsgrupp fått arbeta relativt fritt, och på så sätt har man
lärt sig hur vi ska planera laborationen, för att slippa onödig väntetid. Det gör
att man måste planera laborationerna noggrant om man har steg som måste vila
eller ligga i värme i en timme.
Jag har
också lärt mig det grundläggande i hur man detektera gener inom
molekylärbiologi, och fått en insikt om när man behöver det olika metoderna.
/Nathalie
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar